圓山文化遺址位於臺北市動物園內，於１８９７年（清光緒二十三年）發現。遺址包含上下兩個文化層。上層主體是厚達２米的貝塚層，含大量人類食用後丟棄的貝殼、獸骨和用後棄之的器具，另外有褐色的砂陶，表面塗有紅色顏料或劃有張條，其大多帶有一對由口唇起附上肩上的豎把。該層還出土少量器型獨特、造形優美的雙口罐和磨制的石斧、石鋤、石錛、石鑿、石槍頭、骨魚叉、骨箭頭等生產和捕獵工具。其中最具特色的有肩石斧和有段石錛，是我國東南沿海一帶新石器晚文化的重要特徵。此外還發現有裝飾用太器。下層沒有貝塚，主要出土帶有繩印紋的陶器，是臺北盆地最古老的史前文化之一，據測距今約４５００年，且至少在該地區持續了２０００年。經考古比較推斷，圓山文化的主人可能從今日廣東省海豐到廣州間的沿海地帶遷移而來。